孙荻作恶多端，他因为是迫害高智晟案的直接指挥者而臭名昭著。自从2005年下半年以来，中共以北京市公安局国内安全保卫总队为主的警察和便衣，以极其卑劣的黑社会手段，对高智晟律师实行了长期的系列迫害，包括电话恐吓、跟踪、围堵、殴打及切断通讯设施、剥夺高律师的人身自由。其直接责任人就是北京市公安局国内安全保卫总队处长孙荻。孙荻不仅指挥对高律师的迫害，而且频繁找高律师谈话，威胁、虐待、精神折磨高律师。          

2006年8月15日至2006年12月22日期间，高智晟律师被中共当局非法关押、残酷迫害。在这一百二十九天里，高律师“被拷住双手的时间是六百小时；被固定在特制的铁椅上的时间是五百九十多小时；被左右双向强光灯照射的时间为五百九十多小时；被强制盘腿坐在地板上反思罪过的时间是八百小时左右；被强制擦铺板的次数为三百八十五次。”2006年12月22日，中共司法当局，非法判高智晟律师3年徒刑，缓期5年执行，剥夺政治权利一年。回到住所的高智晟律师被迫搬家，并与公众失去联系。          

2007年6月2日，当被北京市公安局国内安全保卫总队严密监视的高智晟律师前去质问一名于2006年11月24日殴打其妻子耿和的警察时，遭到该警察劈头盖脸的攻击毒打。          

根据北京著名维权人士胡佳的确认：北京市公安局国内安全保卫总队的孙荻处长负责监控高智晟及其妻女的，在高律师被捕期间，所有针对高律师妻子儿女的凌辱和暴力殴打都是由孙荻负责指挥实施的。高律师回家“服刑”之后对其的暴力袭击依然由孙荻负责。          

2006年六四，准备去天安门广场独自纪念六四的浦志强律师被孙荻等北京警察询问并拦阻前往天安门广场，并实施软禁一天。          

2007年4月16日，曾帮助过高智晟律师的访民黄燕被孙荻绑架到设在丰台的湖北驻京办控制起来，后又被孙荻违法软禁30多天，软禁在亚运村怡华宾馆202房。后来孙狄将黄燕湖北老家公安叫来，将其强制带走软禁在荆州五普四湖宾馆二十多天。那间宾馆全封闭式铁窗门，据说是专门关押访民的。          

孙荻也参与迫害艾未未，2011年4月，在孙荻指挥下艾宅第二次被搜查，孙荻对看门人小韦进行了非常粗暴地威胁，他命令小韦交出财物室钥匙，小韦说没有，孙威胁说：“再说没有,我他妈的抽你”。          

2000年后，大凡在北京住过的刑满释放良心犯都曾受到过孙荻的喝茶、盘问和骚扰。根据目前在美国、1997年刑满释放、1999年在家软禁一年后住在北京的郭宝胜先生指证：“孙荻当时是骚扰在京良心犯、异议人士的主要警察，我2000年在一间大型网络公司上班时，他就与多名警察多次前来公司骚扰，导致我不得不离开这家待遇不差的公司。我去其他公司后，孙荻又前来骚扰，最后我不得不进行个体经营，不再到任何公司上班。我也从李海、陈天石、穆文斌等良心犯朋友口中得知，他们也经常受到孙荻等北京国保的骚扰”。